Здійснює методичне керівництво і контроль за дотриманням установленого порядку роботи з документами в структурних підрозділах, забезпечує ведення діловодства та діловодства за зверненнями громадян.
Свою діяльність здійснює відповідно Статуту Державної установи «Житомирський обласний центр контролю та профілактики хвороб МОЗ України», та інших нормативних документів у сфері забезпечення санітарного та епідеміологічного благополуччя населення.
Лабораторія проводить визначення фізичних факторів в навколишньому та виробничому середовищі, а також для потреб атестації робочих місць, акредитації закладів, установ і т.д.
Акредитована в системі НААУ ДСТУ ISO 17025:2006 на проведення випробувань питної води, поверхневих джерел водопостачання , відкритих водойм; стічні води, харчових продуктів, ґрунту, атмосферного повітря, повітря закритих приміщень, виробниче середовище, полімерні матеріали та текстильні вироби, дослідження пестицидів в навколишньому середовищі.
Основними завданнями відділення є: забезпечення професійного функціонування відділення, організаційного та методичного керівництва відокремленими структурними підрозділами лабораторного центру, надання консультативної, а при необхідності практичної допомоги з питань проведення епідеміологічних розслідувань випадків
Здійснює моніторинг довкілля з природно - вогнищевих захворювань (лептоспіроз, лістеріоз, туляремія, ієрсініози, сибірка, сказ), води відкритих водоймищ на виявлення збудника холери. Організує профілактичні та протиепідемічні заходи у вогнищах природно-вогнищевих захворювань, а також геморагічних лихоманок, рикетсіозів, туберкульозу.
Бактеріологічна лабораторія проводить виділення, ідентифікацію та визначення біологічних властивостей мікроорганізмів III-IV груп патогенності шляхом проведення бактеріологічних, біологічних та імунологічних досліджень
Вірусологічна лабораторія є єдиним закладом в області, що проводить обстеження населення за епідеміологічними показаннями та дослідження на грип, гострі інфекції, напругу імунітету до інфекцій, що керуються засобами імунопрофілактики (кір, краснуха, грип, вірусний гепатит В).
Лабораторія проводить виділення, ідентифікацію та визначення біологічних властивостей мікроорганізмів ІІ групи патогенності шляхом проведення бактеріологічних, біологічних та імунологічних досліджень.
Лабораторія має свідоцтво про атестацію вимірювальної лабораторії № 201/15 від 06.10.2015р. та атестат про акредитацію відповідно до вимог ІSО/IEC 17025:2006 «Загальні вимоги до компетентності випробувальних та калібрувальних лабораторій» . Має дозвіл на роботу з мікроорганізмами ІІІ-ІУ групи патогенності № 1/00-1271 від 09.06.15
Забезпечує організацію та проведення розслідувань причин і умов виникнення інфекційних захворювань, визначення факторів передачі інфекції, визначення меж осередків інфекційних хвороб, масштабів поширення та надання пропозицій щодо їх локалізації та ліквідації
Відділ працює як складова системи спостереження, контролю за громадським здоров’ям населення і територій, для запобігання і реагування на надзвичайні ситуації техногенного, природного, соціально-політичного характеру та реалізацію державної політики в сфері громадського здоров’я та санітарно-епідеміологічного благополуччя.